Небольшая коренастая ящерица с длиной туловища 5–8 см и длиной хвоста 7–9 см. Верх тела светло-серый, коричневый или песочный. Рисунок спины в виде поперечных рядов белых глазков в темной окантовке, отличающихся по форме и размеру в разных районах Казахстана. Нижняя сторона тела светлая, иногда немного желтоватая, без пятен. Иногда белые глазки могут сливаться в первой трети туловища в продольные полосы. На боках туловища и бедрах у ящурок из Илийской котловины глазки зеленого или голубоватого цвета, из Центрального Тянь-Шаня – желтого или зеленоватого.
Рисунок молоди похож на взрослых, однако, более яркий и отчетливый.
Разноцветная ящурка отличается от остальных видов выраженным глазчатым рисунком спины, коренастым телосложением, сильной рельефностью щитков головы. От средней ящурки отличается меньшим количеством бедренных пор: 6-13 (как у средней их 12-18), а также тем, что у разноцветной ящурки никогда нет зернышек вокруг надглазничных щитков.